Kurikulum 2020 Program Pendidikan Dokter Spesialis (PPDS) I Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro ini dirancangmdan dikembangkan berdasarkan Buku Kurikulum 2018 Program Pendidikan Dokter Spesialis Mikrobiologi Klinik dan Standar Pendidikan Profesi Dokter Spesialis-1 Mikrobiologi Klinis 2019 yang disusun oleh Kolegium Perhimpunan Dokter Spesialis Mikrobiologi Klinik Indonesia (PAMKI) dan sesuai dengan Standar Nasional Perguruan Tinggi Indonesia (Permenristekdikti No.44 Tahun
2015).
PPDS I Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro menggunakan kurikulum berbasis kompetensi yang tidak hanya mengacu pada bidang kognitif, tetapi juga pada psikomotor dan afektif. Model pembelajaran berpusat pada residen (student-centered learning). Fokus utama selama proses pendidikan dilakukan pendidikan berbasis kerja dan dilakukan di tempat pelayanan kesehatan (laboratorium dan rumah sakit). Lulusan diharapkan memiliki tingkat kompetensi sesuai standar Kerangka Kualifikasi Nasional Indonesia (KKNI). Dengan cara ini, peserta didik diharapkan mencapai kompetensi yang disyaratkan dan bekerja sesuai kompetensinya.